ในปีการศึกษา 2566 โรงเรียนวัฒโนทัยพายัพ ได้กำหนดหลักสูตรที่เปิดสอนไว้ทั้งระดับมัธยมศึกษาตอนต้น และระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย ดังนี้
หลักสูตรระดับมัธยมศึกษาตอนต้น
หลักสูตรระดับมัธยมศึกษาตอนปลาย
| ห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์ วิศวกรรมคอมพิวเตอร์ และหุ่นยนต์ | |||
| ห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์-คณิตศาสตร์เพื่อการพัฒนาทักษะทางภาษาอังกฤษ (EDP) | |||
| แผนการเรียนวิทยาศาสตร์ - คณิตศาสตร์ | |||
| แผนการเรียนคณิตศาสตร์ - ภาษาอังกฤษ | |||
| แผนการเรียนภาษาอังกฤษ - ภาษาจีน | |||
| แผนการเรียนภาษาอังกฤษ - ภาษาญี่ปุ่น | |||
| แผนการเรียนภาษาอังกฤษ - ภาษาฝรั่งเศส - ทัศนศิลป์ - ดนตรี | |||
| แผนการเรียนภาษาอังกฤษ - ภาษาเกาหลี | |||
| แผนการเรียนภาษาอังกฤษ-ภาษาไทย-สังคมศึกษา ศาสนา และวัฒนธรรม | |||
| ห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์การแพทย์ (MSP) | |||
| ห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์ เทคโนโลยี และสิ่งแวดล้อม (SMTE) |