จากพระราชดำรัส สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี “การสอนและอบรมให้เด็กมีจิตสำนึกในการอนุรักษ์พืชพรรณนั้น ควรใช้วิธีการปลูกฝังให้เด็กเห็นความงดงามความน่าสนใจ และเกิดความปิติที่จะทำการศึกษาและอนุรักษ์พืชพรรณต่อไป การใช้วิธีการสอนการอบรมที่ให้เกิดความรู้สึกกลัวว่า หากไม่อนุรักษ์แล้วจะเกิดผลเสีย เกิดอันตรายแก่ตนเอง จะทำให้เด็กเกิดความเครียดซึ่งจะเป็นผลเสียแก่ประเทศในระยะยาว” ซึ่งพระราชทานพระราชดำริให้ดำเนินการกับเยาวชน โดยการฝึกอบรมให้เห็นประโยชน์ ความงดงาม เกิดความปิติที่จะทำการอนุรักษ์ แทนที่จะสอนให้อนุรักษ์แล้วเกิดความเครียด โดยมี “งานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน” เป็นสื่อการเรียนการสอน

      โรงเรียนวัฒโนทัยพายัพ จังหวัดเชียงใหม่ได้เล็งเห็นความสำคัญและประโยชน์ที่เกิดขึ้น จึงสมัครเป็นสมาชิกงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียนตั้งแต่ปีการศึกษา ๒๕๔๓

      ปัจจุบันโรงเรียนดำเนินงานการเรียนการสอนควบคู่กับงานสวนพฤกษศาสตร์ด้วยวิธีการบูรณาการเข้าสู่ ๘ กลุ่มสาระการเรียนรู้ โดยการจัดการเรียนรู้ของผู้เรียนใน ๘ กลุ่มสาระการเรียนรู้ และกิจกรรมพัฒนาผู้เรียนแบบบูรณาการกับลำดับการเรียนรู้ ๕ องค์ประกอบ ๓ สาระ การศึกษาไปสู่ชุมชนฐานทรัพยากรท้องถิ่นโดยผู้เรียนปฏิบัติกิจกรรม ๙ ใบงาน โรงเรียนดำเนินการต่อเนื่องและผ่านการประเมินในระดับที่สูงขึ้นตามลำดับ คือ

      >> ปีการศึกษา ๒๕๔๓  เป็นสมาชิกงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน

      >> ปีการศึกษา ๒๕๔๖  นางอรทัย หนองขุ่นสาร ผู้อำนวยการโรงเรียน รับพระราชทานป้ายสนองพระราชดำริฯ สวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน

      >> ปีการศึกษา ๒๕๔๘  นางปรานอม เชื้อศักดาหงษ์ ผู้อำนวยการโรงเรียน รับระราชทาน เกียรติบัตรแห่งความมุ่งมั่นอนุรักษ์สรรพสิ่ง สรรพชีวิตด้วยไวพจน์แห่งจิตสำนึกของเยาวชน

      >> ปีการศึกษา ๒๕๕๐  นางปรานอม เชื้อศักดาหงษ์ ผู้อำนวยการโรงเรียน รับประกาศจากโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริฯ ที่แสดงว่า โรงเรียนวัฒโนทัยพายัพ “มีความมุ่งมั่นกระทำการพัฒนาสถานศึกษาแห่งตน ในวิถีที่จะนำไปสู่การเป็นสถานศึกษา อบรม สั่งสอนเบ็ดเสร็จเพื่อบุคลากรมีวิทยาการ ปัญญา และภูมิปัญญา เข้าถึงผลประโยชน์แท้แห่งตน บนฐานของงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน”

      >> ปีการศึกษา ๒๕๕๒  นางสาวศรีพรรณ เวียนทอง ผู้อำนวยการโรงเรียน รับพระราชทาน เกียรติบัตรงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน ขั้นที่ ๒ เกียรติบัตรแห่งการเข้าสู่สถานภาพ สถานศึกษาอบรม สั่งสอนแบบเบ็ดเสร็จ บนฐานงานสวนพฤกษศาสตร์โรงเรียน จากองค์ประธานโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืชอันเนื่องมาจากพระราชดำริ สมเด็จพระเทพรัตนราชสุดา ฯ สยามบรมราชกุมารี วันที่ ๑๙ ตุลาคม ๒๕๕๒